日本有四个主要的岛屿，分别为本州、北海道、九州和四国，被一个四通八达的铁路网络所覆盖。对于外国游客来说，火车是游览日本的一种非常方便的交通工具, 这也是因为推出日本铁路周游券的缘故。

大约百分之七十的日本铁路网，特别是在大城市及其周边地区，都是由日本国铁(JR)拥有和营运的，其余百分之三十属于几十个私有铁路公司。

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日本国铁公司(JR)

日本国铁公司(JR集团)前身是JNR (日本国家铁路)公司，后者由于巨大债务于1987年被私有化。

JR集团由六个地方性旅客铁路公司(JR北海道、JR东日本、JR中日本、JR西日本、JR四国和JR九州)和一个全国性的货运铁路公司(JR货运)组成。它们一起连接起城市、地方和跨地区的铁路线、夜间火车和子弹头列车(新干线)的一个全国性网络。

JR各地方公司和新干线营运区域

私有铁路公司

在日本有几十家私有铁路公司。更小的公司只有一条线路，而其他公司则营运着相当广泛的铁路网络。下面列出一些主要的私有铁路公司：

关东:

东武铁道 (大约460km)

http://www.tobu.co.jp/

东武铁道在东京郊区和北部营运着一个广泛的铁路网络。游客可以进入日光。

小田急电铁 (大约120 km)

http://www.odakyu.jp/

小田急电铁营运从东京中部到东京西部和神奈川县的三条线路。游客可以进入箱根。

东急电铁 (大约100 km)

http://www.tokyu.co.jp/

东急电铁在东京南部营运着二条主线和几条更短的线路网络。游客可以进入横滨。

京成电气电铁 (大约100 km)

http://www.keisei.co.jp/

京成电气电铁营运从东京到千叶县的一条主线和几条支线。游客可以进入成田机场。

西武铁道 (大约180 km)

http://www.seibu-group.co.jp/railways/index.html

西武铁道营运东京中央区的西部郊区铁路网络。

京急电铁 (大约90 km)

http://www.keikyu.co.jp/

京急电铁连接东京和横滨以及南部神奈川县。游客可以进入羽田机场。

京王电铁 (大约80 km)

http://www.keio.co.jp/

京王电铁营运东京中央区西部的铁路网络。游客可以进入高尾山。

中部:

名古屋铁道 (大约500 km)

http://www.meitetsu.co.jp/

名古屋铁道在名古屋附近营运一个广泛的铁路网络。游客可以进入犬山城和中部国际机场。

近畿:

近畿铁道 (大约570 km)

http://www.kintetsu.co.jp/

近畿铁道是最大的私有铁路公司，在南部近畿地区营运着一个广泛的铁路网络，服务大阪、京都、奈良、伊势和名古屋。

南海电铁 (大约170 km)

http://www.nankai.co.jp/

南海电铁在大阪南部和和歌山县营运一铁路线路网络。游客可以进入关西机场和高野山。

阪急电铁 (大约150 km)

http://rail.hankyu.co.jp/

阪急电铁在大阪北部营运几条线路，连接大阪和神户以及京都。

京阪电铁 (大约90 km)

http://www.keihan.co.jp/

京阪电铁营运一条主线，连接大阪和京都以及几条更短的线路。

阪神电铁 (大约50 km)

http://rail.hanshin.co.jp/

阪神电铁在大阪和神户之间营运一条主线和几条短支线。

九州:

西日本铁道 (大约120 km)

http://www.nishitetsu.co.jp/

西日本铁道在福冈市附近的福冈营运一铁路线网络。游客可以进入太宰府。